Вирус на флешке, ни для кого не сюрприз. Но вот остаться без важной информации, которая храниться на этой самой флешке, это тот еще казус. Мои знакомые, не однократно форматировали флешки после вирусов, не найдя там ни одного файла. А они могут быть просто скрыты вирусом... Как говориться в нашем деле лучше перебдеть чем недобдеть. И так... Вирус на флешке вылечили, либо удалили. Входим в корневой каталог, а там пусто. Как быть? Я не встречал вирусов, которые бы нахально стирали информацию с накопителей. Так что скорее всего ваши файлы скрыты. А значит надо их показать.

Показываем скрытые файлы и папки.
Для того чтобы показать скрытые файлы. В любом окне нажимаем кнопку Сервис

После этого все скрытые файлы и папки будут отображаться. И если вам повезет, то вы можете просто снять атрибут скрытый в свойствах папки или документа. Для этого, жмем правой кнопкой на нужный документ или папку и выбираем Свойства. Затем снимаем галочку возле атрибута Скрытый.

Но может быть так что данный атрибут файла убать будет невозможно или что еще хуже, Файлы и папки на флешке вовсе не будут отображаться. Тогда, прибегнем к помощи командной строки.

Открываем командную строку. 

Вот и все. Теперь атрибут Скрытый будет удален со всех файлов и папок на вашей флешке. Соответственно и все данные будут отображаться как положено. Если конечно они там есть.